重叠基因如何影响GEDmatch DNA匹配结果?

如果遗传谱系还不够复杂，再加上重叠的基因，你就会陷入一个混乱的世界。你可能会努力确定你和一个未知亲戚的关系，然后震惊地发现你和一个已知亲戚的基因匹配与你之前认为的大不相同。

GEDmatch有一个工具可以帮助你评估和分类DNA重叠区域。

观看这个视频在YouTube上。

重叠基因背后的原理是什么?

当DNA公司检测你的DNA时，他们会检查30亿的50万到90万单个DNA单位(SNPs)。每个基因谱系公司都选择他们想要检查的位置。有些公司选择相同的区域，这被称为覆盖重叠。

当DNA检测公司检测相同的SNP时

例如，FamilyTreeDNA可能与23andMe在大约20万个位点上重叠。因此，你可能会发现:

为了产生DNA匹配，你必须在测试的位置匹配一定数量的厘organ和最小数量的snp。因此，测试重叠基因片段的数量变得至关重要。

虽然23andMe和FamilyTreeDNA都可以测试大约50万个位置，但只有重叠的位置可以测试GEDMatch可以检查时，比较套件从不同的公司。

较小的共享DNA片段可能不会出现在GEDMatch匹配列表中。

当你与另一个DNA测试者共享越来越小的片段时，snp或重叠基因就会越来越少。在某些时候，您可能没有足够的snp来满足GEDmatch上的搜索阈值。因此，由于DNA检测公司之间缺乏重叠的基因检测，你可能看不到基因匹配。

在下面的图表中，你可以看到每个DNA测试公司如何测试snp，并查看重叠的基因片段发生在哪里。

这张图只显示了70万个snp中的10个，用于演示。

左栏定义了四家基因谱系检测公司(AncestryDNA、23andMe、MyHeritage DNA和FamilyTreeDNA)的芯片版本。要认识到，每次他们改变芯片版本时，这些公司都会改变测试中包含的snp。

如果我们将家谱dna与祖先dna测试进行比较，我们会看到家谱dna在2、3、4、7、8和10上测试。与Ancestry的重叠点只有2、3和10。这些差距表示GEDmatch缺乏可供比较的数据。

当差异变得足够大时，你可能会在GEDmatch上失去匹配，因为这些工具无法比较来自这些地区的两个不同检测公司的DNA。

当比较一家公司的不同芯片版本时(例如Ancestry Version 1和Ancestry Version 2)，即使两个套件使用同一家公司，匹配结果也可能不再出现。

↪️对DNA和家谱感到困惑?

拿起你的这个免费的DNA指南:

ISOGG网站有一个常染色体SNP比较图这显示了测试之间有多少重叠。在大多数情况下，重叠的基因片段大约有几十万个或更多的snp。

然而，GEDmatch重叠有点不同。根据我对所有不同公司进行的测试，我创建了这个重叠的snp表。

世界杯预选赛最新积分榜常染色体SNP比较图

这个GEDmatch数据库对比图不同于ISOGG网站上的重叠基因图。为什么会这样?

首先，GEDmatch不会查看每一个被测试的SNP。GEDmatch始于2010年。当时，只有FamilyTreeDNA和23andMe提供DNA测试。23andMe的版本3芯片测试了超过900,000个snp。根据重叠，

GEDmatch正在检测这些SNP片段中的绝大多数(近85万个)。

利用家族树dna芯片，他们测试了大约70万个snp。GEDmatch检查其中的大部分(620,000个位置)。这些snp大多与23andMe的snp重叠。GEDmatch只添加了几千个额外的家谱dna snp。

我不知道，但GEDmatch仍然使用其中的大部分。

随着时间的推移，23andMe换了芯片。AncestryDNA开始DNA测试的过程中改变了它的芯片。MyHeritage DNA开始提供DNA测试(并使用家族树DNA芯片)。最后，LivingDNA上市了，用户开始将这些试剂盒转移到GEDmatch。

由于GEDmatch存储数据的方式，GEDmatch可能不想扩展它审查的整体SNP计数。如果他们这样做了，他们可能会使过去的一些结果无效。无论如何，GEDmatch仍在继续检测最初的87万个snp位点。

简而言之，GEDmatch主要基于23andMe Version 3芯片和原始的FamilyTreeDNA芯片来审查特定的snp选择。

当您比较23andMe版本3测试、FamilyTreeDNA测试或MyHeritage DNA测试时，您将得到最佳匹配结果。

来自AncestryDNA芯片的DNA匹配仍然覆盖了23andMe和FamilyTreeDNA测试之间大约400,000个共同的snp。当您尝试比较更新的23andMe芯片和活DNA芯片时，您将在GEDmatch上比较较少的DNA片段。因此，缺乏重叠的基因段会对GEDmatch的结果产生不利影响。

在这个视频中，我将更多地解释重叠基因片段，以及它如何影响你的遗传谱系研究。一定要看下面的视频。

关键是，如果你只处理一个匹配，一定要注意你是否有大量的重叠。您将确保您正在查看来自不同测试公司的所有DNA匹配。