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  • 安迪李

GEDmatch超级试剂盒能比非超级试剂盒提供更多的DNA匹配吗?


你有没有想过GEDmatch超级套件是否会给你更多的比赛?不要再疑惑了。


在Facebook上,我最近与一些人讨论了《Superkits》以及你所获得的匹配。讨论最终考虑了GEDmatch Superkits是否为您提供更多的DNA匹配。


我决定试着看看这些超级套件是否会给你更多的比赛。



什么是Superkit?


一个GEDmatch Superkit是两个或多个DNA试剂盒的组合。基本上,如果你在任何两家基因谱系公司(23andMe、Ancestry DNA、Family Tree DNA、MyHeritage DNA或Living DNA)进行过测试,你就可以将你的DNA数据组合到一个试剂盒中。这会产生更多的snp。


也许你测试了Ancestry DNA、23andMe和MyHeritage。每个试剂盒都有不同的单核苷酸多态性,但有些这些snp重叠。


例如,也许我们将snp编号为1 - 10。然后我们记录下每个公司拥有的不同snp。可能:

  • Ancestry有snp 1、2、4、6、7和9。

  • 23andMe有snp 2、3、4、6、7、8、10。

  • MyHeritage有SNPs 1、2、3、5、6、8、9、10


通过将这些工具包的结果结合在一起,我们创建了一个Superkit,但是只在GEDmatch上。


当我们比较每家公司的结果时,我们确实发现了SNP 1-10的覆盖率。尽管每个试剂盒单独都没有那么多snp,但我们的超级试剂盒最终都有10个snp。


好的事情是GEDMatch Superkit是针对你有多个SNP副本的情况。该工具将有多个地方对自身进行验证。


如果每个公司之间的snp冲突,那么GEDmatch将不会使用该数据,因为它不能确定哪个是正确的。


然而,我们最终在Superkit中获得了比任何单独试剂盒中更多snp的试剂盒。



一定要听我更全面地解释了这些问题在这个视频中。


超级试剂盒会让你看到更多的DNA匹配吗?


这是我们可以根据实际数据来研究的。我用过多家公司我制作了多种不同类型的Superkits。在上面的视频中,我向你展示了数据,并解释了我的发现。


当我把我测试过的各种商业基因谱系公司的不同试剂盒结合起来时,我确实发现了一些差异。


为什么SNP总数会出现差异?


也许这取决于GEDmatch如何解释不同的snp。


当GEDmatch最初创建时,只有23andMe和家谱DNA在市场上可用。因此,GEDmatch最初是为了比较这些公司的套件而创建的。就snp数量而言,23andMe和家谱DNA大致相当,这是有道理的。


然而,如果你在2017年之前用23andMe测试,你将使用一个较旧的芯片版本,这意味着你的Superkit将有更少的snp可供比较。


我相信MyHeritage和家谱DNA使用相同的芯片,因为MyHeritage DNA是在家谱DNA实验室处理的。因此,我注意到MyHeritage的一小部分snp与家谱DNA试剂盒不同。


所以,我可以理解为什么23andMe, MyHeritage和家谱DNA在GEDmatch中有大致相同的匹配量。


对于Ancestry, GEDmatch数据库没有针对该Ancestry工具包进行优化。血统测试发现的大量snp不是GEDmatch数据库的一部分。因此,一些数据会丢失。


对于活DNA,他们使用的是新的处理芯片。有时,snp的数量与家谱DNA、MyHeritage和23andMe一致。但在某些情况下,它的snp数量不到总snp数量的一半。


我相信新旧芯片之间的差异导致了不同的snp和DNA匹配总数。


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拿起你的这个免费的DNA指南:


你会得到更多的火柴吗?


这取决于你如何创建你的Superkit。

  • 如果你使用23andMe版本3测试作为基准,那么你可能会少得到10%的匹配。

  • 如果你使用你的祖先作为主套件和另一个套件,那么你可能会得到更少的匹配。

在我的实验中,我发现除了Ancestry套件外,我的两个超级套件都比其他任何一个测试套件都有更少的匹配。


当涉及到你是否会得到20厘米或更多的匹配时,我发现这些超级套件之间实际上差别很小。


因此,虽然你可能会得到更少的匹配,但看起来你不会得到那些较高CM量的匹配。


总结一下,你在做什么使用GEDmatch Superkit可以消除许多错误的匹配或者是边缘匹配。然而,如果DNA匹配共享超过20厘米的器官,它们就会固化。


这样的匹配非常长,涉及到很多snp,所以添加更多snp将其变为“不匹配”或从列表中删除该匹配的可能性非常低。


希望这能回答你关于GEDmatch超级试剂盒如何影响你收到的DNA匹配数量的问题。


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